estaban modernizando
-they/you were modernizing
Imperfecto progresivo para el sujeto ellos/ellas/ustedes del verbo modernizar.

modernizar

Pero lo que cambió el clima en el tiempo de Charles Darwin fue que las ciencias naturales se estaban modernizando y profesionalizándose, con sus propias sociedades, reuniones y publicaciones.
But what changed the climate of Darwin's times was that the natural sciences were becoming modernized and professionalized, with their own societies, meetings, and publications.
Palabra del día
el abeto